MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium marinum M plasmid pMM23

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010604	GC	3	6	52	57	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010604	CGC	2	6	122	127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010604	GCT	2	6	133	138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010604	CTG	2	6	146	151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010604	CG	4	8	209	216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010604	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010604	TCG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010604	TCAC	2	8	1395	1402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010604	TC	3	6	1425	1430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010604	ACCC	2	8	1489	1496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_010604	ACC	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010604	TG	3	6	1548	1553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010604	GC	3	6	1569	1574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010604	GC	3	6	1580	1585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010604	GGT	3	9	1598	1606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010604	GGC	3	9	4967	4975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010604	GACA	2	8	8728	8735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010604	CAGCCA	3	18	8738	8755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010604	GTG	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010604	TG	3	6	8830	8835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010604	TCG	2	6	9509	9514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010604	CGC	2	6	10175	10180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010604	CGA	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010604	TCG	2	6	14335	14340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010604	CCG	2	6	14361	14366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010604	AGA	2	6	16196	16201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010604	GCCG	2	8	16206	16213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010604	CCG	2	6	16817	16822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010604	AGG	2	6	18108	18113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010604	CG	3	6	18161	18166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010604	T	6	6	18196	18201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010604	GCG	2	6	18339	18344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010604	TGA	2	6	18356	18361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010604	G	6	6	18431	18436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010604	ACC	2	6	19325	19330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010604	CATA	2	8	19356	19363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010604	GGGC	2	8	20625	20632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010604	GC	4	8	20631	20638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010604	C	6	6	20641	20646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_010604	TC	3	6	20676	20681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010604	CGA	2	6	20685	20690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010604	GCCC	2	8	20712	20719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_010604	CG	3	6	20721	20726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010604	TTG	2	6	20753	20758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010604	GCC	2	6	20922	20927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010604	ACG	2	6	20935	20940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010604	ACG	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010604	AAG	2	6	21034	21039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010604	AG	3	6	21038	21043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010604	GAC	2	6	21047	21052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010604	ACC	2	6	21078	21083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010604	CCG	2	6	21315	21320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010604	GGGGA	2	10	21326	21335	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010604	GGTG	2	8	21368	21375	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010604	GTC	2	6	21379	21384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010604	CCG	2	6	21396	21401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010604	GCC	2	6	21434	21439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010604	CGGG	2	8	21473	21480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010604	AGT	2	6	21764	21769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010604	TTGC	2	8	21781	21788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010604	GCAC	2	8	21795	21802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010604	GTG	2	6	21812	21817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010604	GGCT	2	8	22442	22449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.